圖論在RNA二級結(jié)構(gòu)中的應(yīng)用

圖論是以圖為研究對象的數(shù)學(xué)分支,是一門研究事物對象在圖表示法中的特征與性質(zhì)的學(xué)科.鑒于RNA二級結(jié)構(gòu)在功能基因組研究中的重要地位,已發(fā)展了用二維圖解表示法描述RNA二級結(jié)構(gòu).文章介紹了用于RNA二級結(jié)構(gòu)圖解表示法的兩種圖,即樹圖和對偶圖的構(gòu)造規(guī)則.并在樹圖表示基礎(chǔ)上產(chǎn)生Laplacian矩陣和相應(yīng)本征值譜.以有害突變預(yù)測和類RNA模體設(shè)計的例子,說明圖論在RNA二級結(jié)構(gòu)中的應(yīng)用,同時對可能存在的一些問題做了討論.

作 者： 周文彥 曹槐 ZHOU Wen-yan CAO Huai   作者單位： 云南大學(xué)現(xiàn)代生物學(xué)研究中心,昆明,650091  刊 名： 生物信息學(xué)  ISTIC 英文刊名： CHINA JOURNAL OF BIOINFORMATICS  年，卷(期)： 2008 6(3)  分類號： Q111  關(guān)鍵詞： 圖論   RNA二級結(jié)構(gòu)   樹圖   對偶圖   Laplacian矩陣本征值  

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