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仔豬12種致病菌的16 S rRNA分析
研究仔豬12種致病菌的16 S rRNA基因序列,分析其親緣關(guān)系,為設(shè)計其16 S rRNA基因的診斷探針提供理論依據(jù).從美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)基因庫中下載332條仔豬12種致病菌的16S rRNA基因序列,應(yīng)用雙序列比對和構(gòu)建系統(tǒng)進化樹的方法對這些序列進行種內(nèi)分析,選出每種細菌的代表序列,再對代表序列用同法進行種間分析,并將種間分類結(jié)果與伯杰氏細菌分類手冊(第8版)的分類結(jié)果進行比較.從每種細菌的數(shù)據(jù)庫中選出一條接近16 S rRNA基因序列全長,與同種其他序列的核苷酸替代率差異較小的序列為該種細菌的代表序列,進行種間16 S rRNA基因序列系統(tǒng)進化分析,結(jié)果與伯杰氏細菌分類手冊(第8版)的分類基本一致.該16 S rRNA基因的系統(tǒng)進化分析所提供的信息將用于下一步針對這12種致病菌的16 S rRNA基因診斷探針的設(shè)計.
作 者: 梁之昶 陳小玲 相磊 章振華 姚剛 楊兵 作者單位: 梁之昶(新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院,新疆烏魯木齊,830052;北京市農(nóng)林科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所,北京,100097)陳小玲,章振華,楊兵(北京市農(nóng)林科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所,北京,100097)
相磊(江西農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院,江西南昌,330045)
姚剛(新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院,新疆烏魯木齊,830052)
刊 名: 動物醫(yī)學(xué)進展 PKU 英文刊名: PROGRESS IN VETERINARY MEDICINE 年,卷(期): 2007 28(7) 分類號: Q789 S858.28 關(guān)鍵詞: 16 S rRNA基因 致病菌 雙序列比對 系統(tǒng)進化分析 仔豬【仔豬12種致病菌的16 S rRNA分析】相關(guān)文章:
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